C02对菌体的生长有直接作用，碳水化合物的代谢及微生物的呼吸速率下降。大量实验表明，C02对生产过程具有抑制作用。
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基因工程的发展为人类快速获取一些高效菌种提供了新方法。微生物学家发现微生物对污染物的降解性与其所带的质粒有关。利用降解性质粒的相容性，把能够降解不同有害物的质粒组合到一个菌种中，组建一个多质粒的新菌种，这样能使一种微生物降解多种污染物或完成降解过程的多个环节，或使不带降解性的菌带上质粒从而获得降解性...
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微生物形态学观察对于发酵从业者的意义有两点：1工作菌生产状态的快速在线确认；2生产、实验过程中所染杂菌的直观判断。
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任何工业过程都面临着以低成本生产高价值产品的任务，发酵工业也是如此。对发酵过程中的经济因素进行研究，从中找到降低生产成本的有效途径，并建立一套过程经济学的评价体系是发酵工业所必需的，是为发酵经济学。
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